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crispr系统中sgrna和grna一样吗?
个人认为是功能一样、实质是不一样。gRNA负责的是真核细胞内的 RNA加工 的常规步骤,它配对的是RNA,而且只能对mRNA增添或删除U。
而sgRNA是细菌、古菌里的系统,是负责识别特定自身基因组 DNA序列 的工具,它配对的是DNA,而且识别的是5`-GN19NGG-3`(CRISPR的靶点序列),然后Cas9再在靶点处把DNA切断。
grna和sgrna区别?
sgrna是single guide RNA(单导向RNA)的缩写。在CRISPR/Cas9系统中sgRNA与gRNA是一个概念。
CRISPR(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats)是原核生物基因组内的一段重复序列,是生命进化历史上,细菌和病毒进行斗争产生的免疫武器,简单说就是病毒能把自己的基因整合到细菌,利用细菌的细胞工具为自己的基因复制服务。
细菌为了将病毒的外来入侵基因清除,进化出CRISPR-Cas9系统,利用这个系统,细菌可以不动声色地把病毒基因从自己的基因组上切除,这是细菌特有的免疫系统。
求助Real-Time PCR的详细步骤及注意事项?
实时荧光定量PCR技术即是在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。实时荧光定量PCR避免了传统PCR以终产物检测定量产生的偏差,提高实验的重复性。该技术已被广泛用于检测细胞mRNA表达量的变化;比较不同组织的mRNA表达差异;验证基因芯片,siRNA干扰的实验结果。主要实验步骤如下:
1.设计并合成RealtimePCR引物。
2.引物溶解后使用Promega的TaqDNA聚合酶进行含SG(SYBR®Green)的PCR反应的优化。
3.样品RNA抽提a.实验对象为组织样品,取适量(50-100mg)新鲜组织样品或正确保存的组织样品,加1ml的RNA抽提试剂Trizol(Invitrogen),匀浆后抽提RNA。b.实验对象为细胞样品,每份样品取1×106~1×107细胞,PBS清洗细胞,去PBS加1ml的RNA抽提试剂Trizol(Invitrogen),裂解后抽提RNA。
4.RNA质量检测a.紫外吸收测定法测定RNA在分光光度计260nm和280nm处的吸收值,以计算其浓度并评估RNA纯度。b.使用甲醛电泳试剂进行变性琼脂糖凝胶电泳,检测RNA纯度及完整性。
5.使用逆转录酶(Promega)进行反应,将样品RNA逆转录为cDNA。
6.制备标准曲线样品:进行相对定量,需要先将样品的目的基因以及管家基因进行PCR扩增,其产物进行梯度稀释用于做标准曲线7.标准曲线样品和待测样品分别加入到含SG的RealTimePCR反应液中(其中TaqBeadTM热启动聚合酶来自Promega公司),进行RealTimePCR扩增和检测8.检测结果进行标准曲线分析,以对待测样品的目的基因进行定量。相对定量实验需要进一步用样品的目的基因测得值除以管家基因测得值以校正误差,所得结果代表某样品的目的基因相对含量。
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